Nogometna priča u Stupniku traje još od 1962. godine, kada je skupina lokalnih sportskih entuzijasta osnovala klub koji će s vremenom postati jedan od važnijih sportskih simbola općine. Prvi predsjednik bio je Slavko Lisec, a NK Stupnik od samih početaka nije bio samo nogometni klub, nego i važno mjesto okupljanja lokalne zajednice. Upravo su se oko kluba razvijale i poznate sportske igre „Stupnik-Sloboda“, koje su okupljale mještane kroz nogomet, šah, stolni tenis, biciklizam i druge sportove.
Najveći uzlet klub je doživio tijekom druge polovice devedesetih. Od 1995. godine NK Stupnik gotovo iz sezone u sezonu napreduje u viši rang, a vrhunac tog razdoblja dolazi 1999. godine povijesnim ulaskom u Treću HNL. U tim je godinama Stupnik izgradio reputaciju ozbiljne i borbene momčadi te se etablirao kao jedan od najstabilnijih klubova zagrebačkog prstena.
Danas se seniorska momčad natječe u 4. NL Središte Zagreb – Podskupina B, dok klub paralelno puno ulaže u infrastrukturu i uvjete za rad. Posebno se ističe projekt novog terena s umjetnom travom i LED rasvjetom u sklopu ŠRC Stupnik, čime se dodatno podiže kvaliteta treninga i utakmica kroz cijelu godinu.
Velika snaga kluba ostaje i njegova Škola nogometa, koja okuplja velik broj djece iz Stupnika i okolice kroz sve uzrasne kategorije. Od prstića i limača pa sve do juniora, cilj je stvarati nove generacije igrača i zadržati onu prepoznatljivu vezu između kluba i mjesta. Više od šest desetljeća nakon osnutka, NK Stupnik i dalje gradi svoju priču na istoj osnovi – lokalnoj zajednici, radu s mladima i ljubavi prema nogometu.